## File Structure

```
├── Data                                          # <== MedVision_DATA_DIR
  ├── Datasets                                    # <== preprocessed data
    ├── AbdomenAtlas1.0Mini
      ├── Images
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz            		# <== Our annotations
    ├── AbdomenCT-1K
      ├── Images
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── AMOS22
      ├── AMOS22-CT
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── AMOS22-MRI
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── autoPET-III
      ├── Images-CT
      ├── Images-PET
      ├── Landmarks-Label1
      ├── Landmarks-Label1-fig
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── BCV15
      ├── BCV15-Abdomen
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── BCV15-Cervix
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── BraTS24
      ├── BraTS24-GLI
        ├── Images-t1c
        ├── Images-t1n
        ├── Images-t1f
        ├── Images-t1w
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Landmarks-Label3
        ├── Landmarks-Label3-fig
        ├── Landmarks-Label4
        ├── Landmarks-Label4-fig
        ├── Masks
      ├── BraTS24-MEN-RT
        ├── Images-t1c
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Masks
      ├── BraTS24-MET
        ├── Images-t1c
        ├── Images-t1n
        ├── Images-t1f
        ├── Images-t1w
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Landmarks-Label3
        ├── Landmarks-Label3-fig
        ├── Masks
      ├── BraTS24-PED
        ├── Images-t1c
        ├── Images-t1n
        ├── Images-t1f
        ├── Images-t1w
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Landmarks-Label3
        ├── Landmarks-Label3-fig
        ├── Landmarks-Label4
        ├── Landmarks-Label4-fig
        ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── CAMUS
      ├── Images
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── Ceph-Biometrics-400
      ├── Images
      ├── Landmarks
      ├── Landmarks-fig
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── CrossMoDA
      ├── Images
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── FeTA24
      ├── Images
      ├── Images-reoriented
      ├── Landmarks
      ├── Landmarks-fig
      ├── Masks
      ├── Masks-reoriented
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── FLARE22
      ├── Images
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── HNTSMRG24
      ├── HNTSMRG24-midRT
        ├── Images
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Masks
      ├── HNTSMRG24-preRT
        ├── Images
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── ISLES24
      ├── Images-ADC
      ├── Images-DWI
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── KiPA22
      ├── Images
      ├── Landmarks-Label4
      ├── Landmarks-Label4-fig
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── KiTS23
      ├── Images
      ├── Landmarks-Label2
      ├── Landmarks-Label2-fig
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── MSD
      ├── MSD-BrainTumour
        ├── Images-FLAIR
        ├── Images-T1gd
        ├── Images-T1w
        ├── Images-T2w
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Landmarks-Label3
        ├── Landmarks-Label3-fig
        ├── Masks
      ├── MSD-Colon
        ├── Images
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Masks
      ├── MSD-Heart
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── MSD-HepaticVessel
        ├── Images
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Masks
      ├── MSD-Hippocampus
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── MSD-Liver
        ├── Images
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Masks
      ├── MSD-Lung
        ├── Images
        ├── Landmarks-Label1
        ├── Landmarks-Label1-fig
        ├── Masks
      ├── MSD-Pancreas
        ├── Images
        ├── Landmarks-Label2
        ├── Landmarks-Label2-fig
        ├── Masks
      ├── MSD-Prostate
        ├── Images-ADC
        ├── Images-T2w
        ├── Masks
      ├── MSD-Spleen
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── OAIZIB-CM
      ├── Images
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── SKM-TEA
      ├── Images-E1
      ├── Images-E2
      ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
    ├── TopCoW24
      ├── TopCoW24-CT
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── TopCoW24-MR
        ├── Images
        ├── Masks
      ├── benchmark_plan_*.json.gz
  ├── src                                         # <== source code for medvision_ds
  ├── .downloaded_datasets.json                   # <== dataset status tracker
```